合同到期离职是否扣工资，要结合具体情况分析。通常而言，单位不能随意扣减工资，但在法定或约定情形下，扣减可能合法。
1. 若单位毫无正当理由扣工资，比如仅因员工不愿续签合同就扣钱，这种行为违法，员工有权要求单位足额支付剩余工资。
2. 若员工未按规定办理工作交接，给单位造成实际经济损失，单位可依据劳动合同或规章制度，在合理范围内扣工资赔偿损失，但扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
3. 若员工在职时有未结清的借款、赔偿款等，且双方事先有明确约定，单位可在离职时从工资中扣除相应款项，但需提供充分证据证明债务关系。
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合同到期离职时，工资被扣可能带来法律风险，需格外注意。
1. 证据不足风险：例如员工主张被扣工资，却只有劳动合同，拿不出工资条、考勤记录或单位扣工资的书面通知，仲裁或诉讼时无法有效证明被扣事实和金额，可能导致维权失败。
2. 过了仲裁时效风险：假设员工2023年1月合同到期离职，3月发现被扣5000元工资，但因忙新工作没及时维权，直到2024年2月才申请劳动仲裁，此时已超过一年仲裁时效，仲裁委可能不受理或驳回申请，员工无法通过法律途径追回工资。
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合同到期离职时，以下特殊或例外情况会影响工资扣减的认定和处理结果。
1. 劳动合同有合法有效的违约金条款：若合同明确约定员工合同到期前不续签且未提前通知，需支付一定违约金，且该条款合法（如针对服务期或竞业限制），单位可从工资中扣违约金，但扣除后工资不得低于最低工资标准，此时扣工资合法，员工无权要求返还。
2. 员工在职给单位造成重大经济损失且未赔偿：比如员工离职前因操作失误损坏设备，维修费达万元，双方未就赔偿达成协议，单位可依据《工资支付暂行规定》第十六条，逐月从工资中扣赔偿费，每月扣除不超过当月工资的20%，这种扣工资是合法抵扣，员工要承担赔偿责任。
3. 单位因经营困难协商延期支付工资：若单位因疫情等不可抗力经营严重困难，与员工协商一致合同到期离职后暂缓支付部分工资，并书面约定支付时间，此时未按时支付不算“无故克扣”，员工要按协议主张权利，直接要求立即支付可能不被支持。
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《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”合同到期离职时，员工按规定交接工作且无违约或给单位造成损失等情形，单位扣工资属于“克扣”，违反该法条。同时，《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条明确，单位未足额支付劳动报酬的，劳动行政部门可责令限期支付，逾期不支付还需加付赔偿金。所以，合同到期离职时，只要员工没有法律规定或合同约定的扣减工资情形，单位扣工资就违法，员工有权要求支付被扣工资。

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